MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces bingchenggensis BCW-1 chromosome

Total Repeats: 337250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016582	GC	3	6	54	59	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016582	CG	3	6	120	125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016582	TCCG	2	8	145	152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016582	CCG	2	6	257	262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016582	CCA	2	6	268	273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016582	CGC	2	6	278	283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016582	TCC	2	6	330	335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016582	ATGA	2	8	341	348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016582	CTC	2	6	540	545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016582	GCCA	2	8	574	581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016582	CCT	2	6	588	593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016582	GCCGC	2	10	600	609	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016582	CGG	2	6	623	628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016582	CGGC	2	8	631	638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016582	CGG	2	6	652	657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016582	CCAG	2	8	680	687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016582	TCG	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982758
18	NC_016582	GAT	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982758
19	NC_016582	CAC	2	6	747	752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982758
20	NC_016582	CG	3	6	793	798	0 %	0 %	50 %	50 %	374982758
21	NC_016582	CGC	2	6	840	845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016582	TGA	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016582	TGC	2	6	904	909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016582	CGT	2	6	935	940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016582	CCA	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016582	GCG	2	6	1036	1041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016582	GC	3	6	1108	1113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016582	CGG	2	6	1137	1142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016582	GCCC	2	8	1143	1150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_016582	CGGG	2	8	1207	1214	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016582	TC	3	6	1216	1221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016582	GCG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016582	GCGG	2	8	1260	1267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016582	GCA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016582	GAG	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016582	CGG	3	9	1316	1324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982759
37	NC_016582	ATC	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982759
38	NC_016582	GGC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982759
39	NC_016582	GC	3	6	1355	1360	0 %	0 %	50 %	50 %	374982759
40	NC_016582	GCGG	2	8	1457	1464	0 %	0 %	75 %	25 %	374982759
41	NC_016582	CAGG	2	8	1473	1480	25 %	0 %	50 %	25 %	374982759
42	NC_016582	CCGG	2	8	1490	1497	0 %	0 %	50 %	50 %	374982759
43	NC_016582	CCT	2	6	1516	1521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982759
44	NC_016582	TCA	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982759
45	NC_016582	AGG	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982759
46	NC_016582	GCC	2	6	1627	1632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982759
47	NC_016582	AACC	2	8	1655	1662	50 %	0 %	0 %	50 %	374982759
48	NC_016582	GTG	2	6	1721	1726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982760
49	NC_016582	CGA	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
50	NC_016582	GTC	3	9	1819	1827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
51	NC_016582	CGT	2	6	1828	1833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
52	NC_016582	GCG	2	6	1907	1912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982760
53	NC_016582	ACG	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
54	NC_016582	GCC	2	6	1964	1969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982760
55	NC_016582	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	374982760
56	NC_016582	CGG	2	6	2127	2132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982760
57	NC_016582	GGGCGA	2	12	2166	2177	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	374982760
58	NC_016582	C	18	18	2184	2201	0 %	0 %	0 %	100 %	374982760
59	NC_016582	AGC	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
60	NC_016582	CTC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982760
61	NC_016582	CTGGAA	2	12	2251	2262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374982760
62	NC_016582	TCG	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
63	NC_016582	GTG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982760
64	NC_016582	TGC	2	6	2372	2377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
65	NC_016582	ACG	3	9	2378	2386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
66	NC_016582	CCT	2	6	2439	2444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982760
67	NC_016582	GTCG	2	8	2478	2485	0 %	25 %	50 %	25 %	374982760
68	NC_016582	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
69	NC_016582	CTC	2	6	2532	2537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016582	GGA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016582	CGC	2	6	2613	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016582	CCA	2	6	2619	2624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016582	CCGG	2	8	2653	2660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016582	CCG	2	6	2715	2720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016582	CG	3	6	2819	2824	0 %	0 %	50 %	50 %	374982761
76	NC_016582	GCC	2	6	2876	2881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982761
77	NC_016582	CGG	2	6	2895	2900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982761
78	NC_016582	GGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982761
79	NC_016582	CGG	2	6	3015	3020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016582	GCA	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016582	GCG	2	6	3039	3044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016582	CGG	2	6	3061	3066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
83	NC_016582	AGC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
84	NC_016582	GCC	2	6	3183	3188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
85	NC_016582	ACC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982762
86	NC_016582	CGG	2	6	3294	3299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
87	NC_016582	GCC	2	6	3339	3344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
88	NC_016582	ATC	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982762
89	NC_016582	CTG	2	6	3356	3361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
90	NC_016582	CCG	2	6	3376	3381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
91	NC_016582	CAG	2	6	3398	3403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
92	NC_016582	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
93	NC_016582	TGG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982762
94	NC_016582	CGA	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
95	NC_016582	TCG	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
96	NC_016582	GCG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
97	NC_016582	GAGC	2	8	3541	3548	25 %	0 %	50 %	25 %	374982762
98	NC_016582	CGG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
99	NC_016582	GCG	2	6	3684	3689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
100	NC_016582	GCT	2	6	3746	3751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
101	NC_016582	CTT	2	6	3763	3768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374982762
102	NC_016582	GCG	2	6	3801	3806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
103	NC_016582	GC	3	6	3843	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
104	NC_016582	GTC	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
105	NC_016582	CAGG	2	8	3965	3972	25 %	0 %	50 %	25 %	374982762
106	NC_016582	CAG	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
107	NC_016582	GTC	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
108	NC_016582	GTC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
109	NC_016582	GAA	2	6	4012	4017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374982762
110	NC_016582	GCCG	2	8	4030	4037	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
111	NC_016582	CGGG	2	8	4074	4081	0 %	0 %	75 %	25 %	374982762
112	NC_016582	TGC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
113	NC_016582	CGT	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
114	NC_016582	CTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982762
115	NC_016582	GCT	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
116	NC_016582	GCG	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
117	NC_016582	GGA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982762
118	NC_016582	GC	3	6	4216	4221	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
119	NC_016582	TGA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982762
120	NC_016582	AGC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
121	NC_016582	CTT	2	6	4309	4314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374982762
122	NC_016582	CAG	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
123	NC_016582	TCA	2	6	4381	4386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982762
124	NC_016582	CAC	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982762
125	NC_016582	GCC	2	6	4422	4427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
126	NC_016582	CG	3	6	4503	4508	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
127	NC_016582	TGC	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
128	NC_016582	GCT	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
129	NC_016582	GC	3	6	4588	4593	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
130	NC_016582	GAGTAC	2	12	4602	4613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374982762
131	NC_016582	CCTG	2	8	4646	4653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016582	TCGGG	2	10	4666	4675	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016582	CCG	2	6	4676	4681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016582	CGGG	2	8	4687	4694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016582	CGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016582	CGT	2	6	4797	4802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016582	GGC	2	6	4850	4855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016582	TCG	2	6	5009	5014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016582	GAT	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016582	GCC	2	6	5056	5061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_016582	TGG	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016582	GGCGGG	2	12	5202	5213	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_016582	CGGC	2	8	5218	5225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016582	GCC	2	6	5230	5235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_016582	AGC	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_016582	CGA	2	6	5955	5960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_016582	GTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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243	NC_016582	TCG	2	6	8430	8435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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268	NC_016582	CGGC	2	8	9554	9561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_016582	CGG	2	6	9648	9653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_016582	CCG	2	6	9684	9689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_016582	GCCCGC	2	12	9751	9762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_016582	TCC	2	6	9800	9805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982769
273	NC_016582	CCA	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982769
274	NC_016582	CGCC	2	8	9855	9862	0 %	0 %	25 %	75 %	374982769
275	NC_016582	T	7	7	10040	10046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_016582	GGGT	2	8	10060	10067	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_016582	CTGA	2	8	10097	10104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
279	NC_016582	GAC	2	6	10109	10114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_016582	TG	3	6	10181	10186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016582	GAG	2	6	10235	10240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_016582	TGG	2	6	11259	11264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_016582	GAG	2	6	11295	11300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_016582	CGG	2	6	11882	11887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_016582	GCG	2	6	18609	18614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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